Reiniciar el recovery y entrar a la opción wipe data... (Que es lo mismo que restablecer datos de fabrica). La diferencia es que con un recovery modificado puedes limpiar el cache, los datos y el dalvik cache.
Me corrigen si me equivoco pero el recovery stock no permite todo eso (ni lo miré, lo cambie al tiro XD)
A propósito desbloquear el BOotloader no hace perder la garantía si no me equivoco (desde enero). Por lo que no hay motivo para no hacerlo si quieres meter un poco de mano al celu
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